Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ciao1Q99KN2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ciao1Q99KN2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ciao1Q99KN2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms