Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Smim11aQ99J19 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Smim11aQ99J19 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Smim11aQ99J19 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Smim11aQ99J19 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Smim11aQ99J19 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Smim11aQ99J19 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Smim11aQ99J19 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Smim11aQ99J19 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Smim11aQ99J19 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Smim11aQ99J19 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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