Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms