Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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SptssbQ925E8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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SptssbQ925E8 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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SptssbQ925E8 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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SptssbQ925E8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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SptssbQ925E8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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SptssbQ925E8 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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SptssbQ925E8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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SptssbQ925E8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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SptssbQ925E8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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SptssbQ925E8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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