Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim59Q922Y2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trim59Q922Y2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trim59Q922Y2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trim59Q922Y2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trim59Q922Y2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trim59Q922Y2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trim59Q922Y2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trim59Q922Y2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trim59Q922Y2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trim59Q922Y2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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