Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms