Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Vmn1r200Q8R281 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Vmn1r200Q8R281 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Vmn1r200Q8R281 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Vmn1r200Q8R281 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Vmn1r200Q8R281 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Vmn1r200Q8R281 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Vmn1r200Q8R281 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Vmn1r200Q8R281 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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Vmn1r200Q8R281 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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