Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5rap2Q8K389 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms