Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Lrit1Q8K099 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Lrit1Q8K099 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Lrit1Q8K099 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms