Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rab11fip3Q8CHD8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rab11fip3Q8CHD8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rab11fip3Q8CHD8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rab11fip3Q8CHD8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rab11fip3Q8CHD8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rab11fip3Q8CHD8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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