Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH72

Trim32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim32Q8CH72 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim32Q8CH72 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms