Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGZ0

Cherp, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CherpQ8CGZ0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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