Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhl11Q8CE33 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhl11Q8CE33 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhl11Q8CE33 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhl11Q8CE33 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhl11Q8CE33 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhl11Q8CE33 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhl11Q8CE33 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhl11Q8CE33 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhl11Q8CE33 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhl11Q8CE33 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhl11Q8CE33 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhl11Q8CE33 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhl11Q8CE33 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhl11Q8CE33 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhl11Q8CE33 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhl11Q8CE33 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhl11Q8CE33 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms