Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Usp38Q8BW70 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Usp38Q8BW70 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
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Usp38Q8BW70 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
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