Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usp1Q8BJQ2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usp1Q8BJQ2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usp1Q8BJQ2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usp1Q8BJQ2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usp1Q8BJQ2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp1Q8BJQ2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp1Q8BJQ2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp1Q8BJQ2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp1Q8BJQ2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp1Q8BJQ2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp1Q8BJQ2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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