Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms