Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim6Q8BGE7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms