Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Htatsf1Q8BGC0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Htatsf1Q8BGC0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms