Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Amigo1Q80ZD8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Amigo1Q80ZD8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Amigo1Q80ZD8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Amigo1Q80ZD8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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Amigo1Q80ZD8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Amigo1Q80ZD8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Amigo1Q80ZD8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Amigo1Q80ZD8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Amigo1Q80ZD8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Amigo1Q80ZD8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Amigo1Q80ZD8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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