Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc1Q80VQ1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms