Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ube3cQ80U95 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ube3cQ80U95 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ube3cQ80U95 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ube3cQ80U95 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ube3cQ80U95 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ube3cQ80U95 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ube3cQ80U95 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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