Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Eci3Q78JN3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms