Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Ccdc88cQ6VGS5 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Ccdc88cQ6VGS5 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Ccdc88cQ6VGS5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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