Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms