Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmeff1Q6PFE7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms