Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scaf8Q6DID3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms