Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms