Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pram1Q6BCL1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms