Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PtprdQ64487 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PtprdQ64487 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PtprdQ64487 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PtprdQ64487 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PtprdQ64487 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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PtprdQ64487 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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