Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tbr1Q64336 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms