Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ift52Q62559 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms