Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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