Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms