Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Hes3Q61657 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Hes3Q61657 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Hes3Q61657 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Hes3Q61657 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Hes3Q61657 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Hes3Q61657 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Hes3Q61657 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Hes3Q61657 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hes3Q61657 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms