Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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Slc6a4Q60857 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Slc6a4Q60857 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Slc6a4Q60857 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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