Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PtprnQ60673 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PtprnQ60673 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PtprnQ60673 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PtprnQ60673 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PtprnQ60673 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PtprnQ60673 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PtprnQ60673 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PtprnQ60673 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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