Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms