Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Fam208bQ5DTT3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Fam208bQ5DTT3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Fam208bQ5DTT3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Fam208bQ5DTT3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Fam208bQ5DTT3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Fam208bQ5DTT3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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