Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms