Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms