Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chpf2Q3UU43 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms