Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

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Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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