Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms