Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nom1Q3UFM5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nom1Q3UFM5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms