Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms