Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm17219-201ENSMUST00000168439 593 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf166Q3U9F6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms