Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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