Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms