Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms