Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms